Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIPSNAP2O75323 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms