Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCC9O60706 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCC9O60706 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms