Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM38O00635 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms