Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SRRM3A6NNA2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM3A6NNA2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms