Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RGPD3A6NKT7 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RGPD3A6NKT7 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms