Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP3K4Q9Y6R4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms