Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
UBE2D4Q9Y2X8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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UBE2D4Q9Y2X8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D4Q9Y2X8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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