Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms