Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFMBT1Q9UHJ3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms