Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC180Q9P1Z9 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC180Q9P1Z9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms