Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms