Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DNAJC17Q9NVM6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms