Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CENPMQ9NSP4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CENPMQ9NSP4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms