Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOMER3Q9NSC5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms