Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms