Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms