Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARFGAP3Q9NP61 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARFGAP3Q9NP61 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms