Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRIM54Q9BYV2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM54Q9BYV2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms