Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB11FIP5Q9BXF6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms