Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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IFT27Q9BW83 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
IFT27Q9BW83 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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