Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RBBP8Q99708 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms