Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C2orf48Q96LS8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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