Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALPK3Q96L96 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms