Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SUSD3Q96L08 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SUSD3Q96L08 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SUSD3Q96L08 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SUSD3Q96L08 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SUSD3Q96L08 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SUSD3Q96L08 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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