Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SPTSSAQ969W0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSAQ969W0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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