Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms