Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms