Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms