Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MYRIPQ8NFW9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms