Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ZNF439Q8NDP4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ZNF439Q8NDP4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ZNF439Q8NDP4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ZNF439Q8NDP4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ZNF439Q8NDP4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ZNF439Q8NDP4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
ZNF439Q8NDP4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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