Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDZD4Q76G19 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms