Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

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Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ZNF449Q6P9G9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ZNF449Q6P9G9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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ZNF449Q6P9G9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF449Q6P9G9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF449Q6P9G9 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms