Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LETMD1Q6P1Q0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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