Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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FAM208BQ5VWN6 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FAM208BQ5VWN6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FAM208BQ5VWN6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
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