Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
STRIP1Q5VSL9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms