Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms