Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC153Q494R4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms