Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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