Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSNAXIP1Q2TAA8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms