Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCBQ16585 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms