Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNGA3Q16281 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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