Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VAMP3Q15836 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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