Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CST6Q15828 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CST6Q15828 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CST6Q15828 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CST6Q15828 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CST6Q15828 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CST6Q15828 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CST6Q15828 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CST6Q15828 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms