Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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NCOA1Q15788 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NCOA1Q15788 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NCOA1Q15788 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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