Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RAB35Q15286 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms