Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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NCF4Q15080 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NCF4Q15080 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NCF4Q15080 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NCF4Q15080 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NCF4Q15080 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NCF4Q15080 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NCF4Q15080 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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NCF4Q15080 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NCF4Q15080 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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