Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMC1AQ14683 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
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