Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DDX39BQ13838 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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