Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL4BQ13620 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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