Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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CUL4AQ13619 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CUL4AQ13619 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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